安徽省醫藥技工學校是1980年經安徽省人民政府批準成立，是全省唯一一所醫藥類中等技術學校;1996年被安徽省勞動廳評估認定為合格技工學校;1998年經國家勞動部批準成立全省唯一一家全省醫藥行業職業技能鑒定站，是我省醫藥行業職業技能等級考核評定的權威機構;2002年經淮南市人事局評估認定為淮南醫藥、化工類專業人員繼續教育培訓基地;2003年5月經淮南市教育局論證調研，報經省教育局同意，在安徽省醫藥技工學校的基礎上掛牌成立淮南市醫藥職業中專學校。學校多次榮獲淮南市文明單位、全國醫藥教育先進集體榮譽稱號。